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Artigo

Root-associated fungal microbiota of nonmycorrhizal Arabis alpina and its contribution to plant phosphorus nutrition

Resumo

A maioria das plantas terrestres vive em associação com fungos micorrízicos arbusculares (FMA) e depende dessa simbiose para extrair o fósforo (P) do solo. A capacidade de estabelecer essa parceria foi perdida em algumas linhagens de plantas, como a Brassicaceae, o que levanta a questão de quais estratégias alternativas de nutrição essas plantas têm para crescer em solos pobres em P. Para entender a contribuição das interações planta-microbiota, estudamos o microbioma fúngico associado à raiz da Arabis alpina (Brassicaceae) com a hipótese de que alguns de seus componentes podem promover a aquisição de P pela planta. Usando o sequenciamento de amplicons do espaçador transcrito interno 2 de fungos, estudamos as comunidades de fungos da raiz e da rizosfera de A. alpina que crescem em condições naturais e controladas, incluindo solos com baixo teor de P, e identificamos um conjunto de 15 táxons de fungos detectados consistentemente em suas raízes. Esse grupo incluía um táxon de Helotiales que apresentava alta abundância nas raízes da A. alpina selvagem que crescia em um solo extremamente limitado em P. Consequentemente, isolamos e posteriormente reintroduzimos um espécime desse táxon em seu solo nativo pobre em P, no qual ele melhorou o crescimento da planta e a absorção de P. O fungo apresentou características semelhantes às da micorriza, incluindo a colonização da endosfera da raiz e a transferência de P para a planta. A análise do genoma revelou uma ligação entre seu estilo de vida endofítico e a expansão de seu repertório de enzimas ativas de carboidratos. Relatamos a descoberta de uma interação planta-fungo que facilita o crescimento de uma planta não micorrízica sob condições nativas limitadas de P, revelando assim uma função anteriormente subestimada da microbiota fúngica da raiz no ciclo de P.



Abstract

Most land plants live in association with arbuscular mycorrhizal (AM) fungi and rely on this symbiosis to scavenge phosphorus (P) from soil. The ability to establish this partnership has been lost in some plant lineages like the Brassicaceae, which raises the question of what alternative nutrition strategies such plants have to grow in P-impoverished soils. To understand the contribution of plant–microbiota interactions, we studied the root-associated fungal microbiome of Arabis alpina (Brassicaceae) with the hypothesis that some of its components can promote plant P acquisition. Using amplicon sequencing of the fungal internal transcribed spacer 2, we studied the root and rhizosphere fungal communities of A. alpina growing under natural and controlled conditions including low-P soils and identified a set of 15 fungal taxa consistently detected in its roots. This cohort included a Helotiales taxon exhibiting high abundance in roots of wild A. alpina growing in an extremely P-limited soil. Consequently, we isolated and subsequently reintroduced a specimen from this taxon into its native P-poor soil in which it improved plant growth and P uptake. The fungus exhibited mycorrhiza-like traits including colonization of the root endosphere and P transfer to the plant. Genome analysis revealed a link between its endophytic lifestyle and the expansion of its repertoire of carbohydrate-active enzymes. We report the discovery of a plant–fungus interaction facilitating the growth of a nonmycorrhizal plant under native P-limited conditions, thus uncovering a previously underestimated role of root fungal microbiota in P cycling.


J. Almario
G. Jeena
J. Wunder
G. Langen
A. Zuccaro
G. Coupland
M. Bucher

2017 - Proceedings of the National Academy of Sciences

Palavras-chave:

Brassicaceae, microbioma, endófito fúngico, Helotiales, transferência de nutrientes

Termos de indexação:

Interações planta-microbiota, ciclagem de fósforo, rizosfera, enzimas, genes, carboidratos, análise genômica

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