Molecular profile of microbiota of Finnish commercial compost suppressive against Pythium disease on cucumber plants

Resumo

O uso de composto de origens variadas para o manejo de doenças de plantas tem sido relatado em todo o mundo há décadas, e sugere-se que os microrganismos sejam uma das forças motrizes. Neste estudo, os compostos produzidos durante dois anos consecutivos foram misturados com turfa na proporção de 1:4 v/v e testados quanto à supressão da doença Pythium do pepino em dois experimentos em 2009. Nove compostos foram selecionados com base em seus efeitos supressivos contra Pythium em plantas de pepino e, em seguida, foram submetidos a análises moleculares. O objetivo deste estudo foi comparar as comunidades bacterianas e fúngicas presentes em compostos fortemente supressivos e não supressivos ou fracamente supressivos, em um esforço para identificar grupos bacterianos e fúngicos associados à supressão da doença de Pythium. O DNA genômico total dos compostos foi extraído e amplificado usando primers direcionados aos genes 16S rRNA e ITS rRNA de bactérias e fungos, respectivamente, antes do sequenciamento 454. Os resultados do sequenciamento indicaram as possíveis funções da bactéria Acidobacteria Gp14 e do fungo Cystobasidiomycetes na supressão da doença da murcha de Pythium, devido à sua presença e ausência em compostos com capacidade de supressão forte e baixa/ausente da doença, respectivamente. A abundância de actinobactérias foi associada positivamente à capacidade de supressão. A concentração de fósforo foi o único fator abiótico associado à supressividade: uma correlação negativa foi encontrada em ambos os experimentos. Esses resultados indicam que determinados grupos de bactérias e fungos podem suprimir a murcha de Pythium, enquanto as condições abióticas podem ser menos importantes.

Abstract