Fungi vs. Fungi in Biocontrol: An Overview of Fungal Antagonists Applied Against Fungal Plant Pathogens

  • K. M. Thambugala
  • D. A. Daranagama
  • A. J. Phillips
  • S. D. Kannangara
  • I. Promputtha
2020 - Frontiers in Cell and Infection Microbiology
Palavras-chave: agentes de controle biológico, controle de doenças, fungicidas, doenças de plantas, patógenos de plantas, filogenia, Trichoderma
Termos de indexação: Fungos, antagonistas, patógenos, análise filogenética, manejo sustentável, biocontrole
 

Resumo

Os patógenos vegetais causam perdas ou danos graves às culturas em todo o mundo, reduzindo significativamente a qualidade e a quantidade dos produtos agrícolas. As tendências mundiais estão mudando no sentido de reduzir o uso de pesticidas sintéticos químicos, enquanto vários métodos, estratégias e abordagens de controle biológico estão sendo usados no manejo de doenças vegetais. Os antagonistas fúngicos desempenham um papel significativo no controle de patógenos e doenças vegetais e são usados como agentes de controle biológico (ACBs) em todo o mundo. Esta revisão fornece uma lista abrangente de ACBs fúngicos usados contra patógenos fúngicos de plantas de acordo com conceitos taxonômicos modernos e esclarece suas relações filogenéticas, pois nomes errados são frequentemente usados na literatura sobre controle biológico. Detalhes de aproximadamente 300 antagonistas fúngicos pertencentes a 13 classes e 113 gêneros são listados juntamente com os patógenos-alvo e as doenças vegetais correspondentes. Trichoderma é identificado como o gênero com maior potencial, compreendendo 25 agentes de controle biológico que têm sido usados contra várias doenças fúngicas das plantas. Além do Trichoderma, nove gêneros são reconhecidos como significativos, compreendendo cinco ou mais espécies antagônicas conhecidas, a saber, Alternaria, Aspergillus, Candida, Fusarium, Penicillium, Pichia, Pythium, Talaromyces e Verticillium. Uma análise filogenética baseada em sequências parciais do gene 28S nrRNA (LSU) de antagonistas fúngicos foi realizada para estabelecer suas relações filogenéticas.

 

Abstract

Plant pathogens cause severe losses or damage to crops worldwide and thereby significantly reduce the quality and quantity of agricultural commodities. World tendencies are shifting towards reducing the usage of chemically synthesized pesticides, while various biocontrol methods, strategies and approaches are being used in plant disease management. Fungal antagonists play a significant role in controlling plant pathogens and diseases and they are used as Biocontrol Agents (BCAs) throughout the world. This review provides a comprehensive list of fungal BCAs used against fungal plant pathogens according to modern taxonomic concepts, and clarifies their phylogenetic relationships because thewrong names are frequently used in the literature of biocontrol. Details of approximately 300 fungal antagonists belonging to 13 classes and 113 genera are listed together with the target pathogens and corresponding plant diseases. Trichoderma is identified as the genus with greatest potential comprising 25 biocontrol agents that have been used against a number of plant fungal diseases. In addition to Trichoderma, nine genera are recognized as significant comprising five or more known antagonistic species, namely, AlternariaAspergillusCandidaFusariumPenicilliumPichiaPythiumTalaromyces, and Verticillium. A phylogenetic analysis based on partial sequences of the 28S nrRNA gene (LSU) of fungal antagonists was performed to establish their phylogenetic relationships.

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