A bibliometric analysis on soil microbial diversity and processes: global trends and methodologies

Resumo

O solo é o habitat mais biodiverso da Terra, abrigando uma multiplicidade de espécies microbianas. Diversos esforços foram realizados nas últimas décadas para levantar a diversidade dessas comunidades microbianas. Ainda assim, faltava uma visão abrangente da literatura que destacasse os temas relevantes e os principais atores. Foi realizada uma análise bibliométrica da literatura sobre microrganismos e processos do solo entre 2011 e 2022, com o objetivo de identificar tendências de pesquisa, metodologias e lacunas de conhecimento sobre os microrganismos do solo. Um banco de dados foi desenvolvido em PostgreSQL e conectado ao programa estatístico R, permitindo a análise dos dados da revisão de literatura por meio de 227 consultas SQL personalizadas. Os dados extraídos foram analisados no R e no Excel. Bactérias e fungos foram os microrganismos do solo mais estudados, respondendo por 78% e 90% dos artigos e patentes nas bases de dados, respectivamente. China e EUA foram os países líderes no estudo da diversidade e dos processos microbianos do solo, estando também na vanguarda da aplicação de métodos moleculares avançados (por exemplo, ômicos). A maioria dos demais grandes publicadores era de países desenvolvidos, especialmente da Europa, ou de grandes economias em desenvolvimento, como Índia e Brasil. Outros países em desenvolvimento, como Argentina, Egito, Irã, México, Paquistão e Filipinas, estiveram entre os principais publicadores em temas relacionados à agricultura. Em conjunto, os resultados mostram que grupos além de bactérias e fungos são pouco estudados, que poucos países dominam a produção científica sobre micróbios do solo e que países da América Latina, África e Ásia estão sub-representados, evidenciando a necessidade de investir em microbiologia do solo nessas regiões.

Abstract

Soil is Earth’s most biodiverse habitat, harboring a multitude of microbial species. Several efforts have been conducted to survey the diversity of these microbial communities in the last decades. Still, a comprehensive overview of the literature highlighting significant topics and key players was needed. We carried out a bibliometric analysis of the literature on soil microorganisms and processes between 2011 and 2022, aiming to identify research trends, methodologies, and gaps in knowledge on soil microorganisms. A database was developed in PostgreSQL and connected with the R statistical program, enabling literature review data analysis through 227 SQL customized queries. The data retrieved from the database was analyzed using R and Excel. Bacteria and fungi were the most studied among soil microorganisms, accounting for 78% and 90% of the articles and patents in the databases, respectively. China and the USA were the leading nations studying soil microbial diversity and processes. These countries were also at the forefront of applying advanced molecular methods (e.g., omics). Most other top publishers were from developed countries, especially Europe, or large developing economies such as India and Brazil. Other developing nations, such as Argentina, Egypt, Iran, Mexico, Pakistan, and the Philippines, were among the top publishers in agriculture-related topics. Altogether, the results show that groups other than bacteria and fungi are understudied, that a few countries dominate the research output on soil microbes, and that countries from Latin America, Africa, and Asia are underrepresented, highlighting the need to invest in soil microbiology science in these regions.